Нужно настроить на сайте оплату заказов через онлайн кассу с синхронизацией этих документов в 1с и выпиской кассового чека с маркированным товаров через 1с (выбор оператора не принципиален, но главное ). Главное условие, чтобы клиент мог оплатить на сайте не только целиком заказ, но и произвольную сумму, за произвольный заказ и эти данные выгружались потом в 1с (через выгрузку с банка или на прямую с сайта)